29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  100 
 
 		 447 aa  868    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  76.23 
 
 		 454 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  73.81 
 
 		 462 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  76.46 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  77.35 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  76.23 
 
 		 454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  76.46 
 
 		 454 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  75.34 
 
 		 455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  73.42 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  76.91 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  76.98 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  61.26 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  63.39 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.6 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  46.08 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  39.34 
 
 		 454 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  40.55 
 
 		 538 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  41.14 
 
 		 524 aa  276  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  40.85 
 
 		 520 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  28.19 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  27.6 
 
 		 476 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  36.55 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  24.7 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  26.06 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  36.54 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  28 
 
 		 664 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 		 663 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 		 663 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  35.16 
 
 		 663 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>