15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  100 
 
 
38 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  86.49 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  66.67 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  74.19 
 
 
161 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  64.71 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  62.5 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  63.64 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  57.14 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  55.88 
 
 
101 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>