277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  100 
 
 
332 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  78.61 
 
 
332 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  82.07 
 
 
332 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  82.07 
 
 
332 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  80.12 
 
 
332 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  79.52 
 
 
332 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  79.52 
 
 
332 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  79.52 
 
 
332 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  78.25 
 
 
341 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3625  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  78.71 
 
 
332 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  58.05 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  58.68 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  60.91 
 
 
332 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  57.53 
 
 
332 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  60.2 
 
 
332 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  59.03 
 
 
332 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.2 
 
 
332 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.79 
 
 
336 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.79 
 
 
336 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.18 
 
 
341 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.86 
 
 
337 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.91 
 
 
337 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  53.64 
 
 
331 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.49 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.51 
 
 
329 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  56.54 
 
 
337 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.76 
 
 
329 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.01 
 
 
337 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.27 
 
 
341 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.76 
 
 
337 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.32 
 
 
331 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.66 
 
 
339 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  55.87 
 
 
346 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  53.66 
 
 
341 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  53.99 
 
 
329 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.66 
 
 
339 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.14 
 
 
340 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.87 
 
 
356 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  52.57 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.62 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  51.98 
 
 
330 aa  360  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.59 
 
 
359 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  54.52 
 
 
327 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  54.72 
 
 
338 aa  358  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.39 
 
 
337 aa  358  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.5 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  53.58 
 
 
329 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  52.12 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  53.73 
 
 
330 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  54.98 
 
 
329 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.5 
 
 
335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  54.98 
 
 
336 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.5 
 
 
335 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  53.18 
 
 
807 aa  352  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.5 
 
 
342 aa  351  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.08 
 
 
341 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  52.73 
 
 
337 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  53.43 
 
 
336 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  53.16 
 
 
329 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.16 
 
 
341 aa  349  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  52.9 
 
 
339 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0618  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.9 
 
 
339 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0236749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  348  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  52.4 
 
 
365 aa  348  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  52.53 
 
 
329 aa  348  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  53.38 
 
 
798 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  53.47 
 
 
337 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.47 
 
 
337 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.47 
 
 
337 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.73 
 
 
335 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  52.85 
 
 
329 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.99 
 
 
341 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  55.45 
 
 
335 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  54.28 
 
 
329 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1762  thiosulphate-binding protein  51.82 
 
 
332 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.478994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  52.96 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  55.96 
 
 
335 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  51.81 
 
 
338 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 
336 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.1 
 
 
341 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2803  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.88 
 
 
336 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.77 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.98 
 
 
351 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2981  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.85 
 
 
345 aa  341  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  54.21 
 
 
329 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>