24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0834 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0834  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  286  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0310  OsmC family protein  66.43 
 
 		 186 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0279  OsmC family protein  65.71 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4634  OsmC family protein  62.14 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1413  OsmC family protein  46.32 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0458  OsmC-like protein  37.69 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  34.51 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  32.09 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  31.19 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  33 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  32.52 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  32.54 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  30.16 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  34.31 
 
 		 418 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  28.32 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  30.77 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  30.77 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  32.99 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.81 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  30.77 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  35.11 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  34.38 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  31.36 
 
 		 413 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  33.33 
 
 		 143 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>