35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0014 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  97.92 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0024  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522989  normal  0.148757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0038  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  0.0114921 
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>