17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0049 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  40.26 
 
 
183 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  32.06 
 
 
220 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  36.88 
 
 
214 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  34.46 
 
 
218 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  34.29 
 
 
172 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  34.21 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  29.09 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  40.28 
 
 
175 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3969  group I intron endonuclease  36.71 
 
 
561 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  31.21 
 
 
220 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1923  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
557 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0236907  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  30.57 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0383  hypothetical protein  30.08 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107146  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  26.15 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0217  hypothetical protein  28.97 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.745262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>