21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4957 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4957  TM2  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  48.08 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  43.48 
 
 		 194 aa  120  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  34.87 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  43.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  46.77 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  39.74 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  46.15 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  40.54 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  48.21 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  46.43 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  40.28 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  41.89 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  45.16 
 
 		 135 aa  50.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  40.85 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  38.36 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>