More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3227 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 425 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  83.45 
 
 		 428 aa  735    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.06 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.06 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.29 
 
 		 423 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  66.59 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.12 
 
 		 423 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.47 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.43 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.6 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.43 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.53 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  49.17 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 429 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.35 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.36 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.26 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.29 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  48.94 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>