18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1740 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  133  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  78.79 
 
 
66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  78.79 
 
 
66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  41.43 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  47.76 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  47.76 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  46.81 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  42.55 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  47.62 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  43.18 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>