41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1707 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  164  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1847  hypothetical protein  48.78 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2505  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  41.25 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3609  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  41.25 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.04 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.04 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.04 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  37.04 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  37.04 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  34.12 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1206  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  39.74 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.53 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.1 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  30.99 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2846  hypothetical protein  58.54 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.18 
 
 
81 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  34.62 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  37.74 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  32.1 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  37.04 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  31.03 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  31.71 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.92 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2357  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.263343  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  32 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.9 
 
 
87 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.6 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.89 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  25.81 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  37.25 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  30.14 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.71 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.5 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.5 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.5 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.5 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.74 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  31.37 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  27.4 
 
 
106 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>