74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3079 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3079  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2783  hypothetical protein  69.19 
 
 
211 aa  287  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7980  hypothetical protein  46.6 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3776  hypothetical protein  47.34 
 
 
210 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.592704  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4416  hypothetical protein  47.32 
 
 
213 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5469  hypothetical protein  47.12 
 
 
218 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2503  hypothetical protein  45.54 
 
 
223 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0772391  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3090  hypothetical protein  44.17 
 
 
210 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2912  hypothetical protein  43.69 
 
 
210 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1724  hypothetical protein  43 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.047148  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5689  hypothetical protein  42.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1729  hypothetical protein  32.7 
 
 
229 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2727  hypothetical protein  34.25 
 
 
232 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000603692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1307  hypothetical protein  30.23 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.970105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0215  hypothetical protein  30.36 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.875175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1380  hypothetical protein  29.77 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2958  hypothetical protein  29.77 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  normal  0.721032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1396  hypothetical protein  29.77 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1419  hypothetical protein  29.77 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2642  hypothetical protein  32.8 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2331  hypothetical protein  32.24 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000057023  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1090  hypothetical protein  29.91 
 
 
223 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2959  hypothetical protein  29.11 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0324  hypothetical protein  29.82 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2120  hypothetical protein  33.02 
 
 
232 aa  92  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1579  hypothetical protein  30.11 
 
 
235 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2863  hypothetical protein  31.72 
 
 
235 aa  92  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3291  hypothetical protein  32.8 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2761  hypothetical protein  31.18 
 
 
237 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1210  hypothetical protein  28.17 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0867  hypothetical protein  28.84 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2693  hypothetical protein  31.18 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0426  hypothetical protein  29.73 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1614  hypothetical protein  31.16 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3432  hypothetical protein  31.55 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1315  hypothetical protein  29.05 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2156  hypothetical protein  32.98 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2390  hypothetical protein  32.02 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0539  hypothetical protein  32.24 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0005  hypothetical protein  34.05 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3594  hypothetical protein  34.97 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0836  hypothetical protein  33.86 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0953  hypothetical protein  33.86 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.275204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0544  hypothetical protein  31.22 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1559  hypothetical protein  32.05 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0752407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2601  hypothetical protein  29.78 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1375  hypothetical protein  26.75 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1419  hypothetical protein  26.75 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31933  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2092  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1556  hypothetical protein  32.14 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.41693  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00763  hypothetical protein  30.15 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.727088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1755  hypothetical protein  27.19 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0019  hypothetical protein  27.6 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000499969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1742  hypothetical protein  28.36 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0143  hypothetical protein  29.23 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1465  hypothetical protein  27.03 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0204  hypothetical protein  28.43 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519496  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1601  hypothetical protein  28.63 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2951  hypothetical protein  29.85 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.282935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0917  hypothetical protein  23.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0199611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2075  hypothetical protein  33.14 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  hitchhiker  0.0000000208246 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1641  hypothetical protein  28.65 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3771  hypothetical protein  25.68 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13383  hypothetical protein  22.99 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4116  hypothetical protein  26.13 
 
 
261 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4216  hypothetical protein  24.22 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0076  hypothetical protein  33.73 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000425303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4024  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0143  hypothetical protein  26.47 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3171  hypothetical protein  37.35 
 
 
261 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07410  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 
456 aa  49.3  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4753  hypothetical protein  25.37 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0078  hypothetical protein  24.31 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.715697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3645  hypothetical protein  46.34 
 
 
51 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>