16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2746 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  834    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  56.31 
 
 
423 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  51.11 
 
 
410 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  51.21 
 
 
397 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  49.59 
 
 
417 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  48.49 
 
 
410 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  25.93 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  27.27 
 
 
653 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  25.94 
 
 
524 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  26.82 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  25.84 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  27.02 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  27.73 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  25.36 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  24.54 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  26.25 
 
 
346 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>