17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0734 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1131  hypothetical protein  37.62 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  40.86 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  37.23 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26720  HIRAN domain-containing protein  34.86 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  34.02 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  30.25 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  32.18 
 
 
135 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1585  hypothetical protein  34.62 
 
 
213 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0176985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1644  hypothetical protein  30.61 
 
 
262 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0035  hypothetical protein  34.78 
 
 
250 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23760  HIRAN domain-containing protein  32.91 
 
 
227 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  31.58 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  29.69 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0286  HIRAN  39.58 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  32.47 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>