29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0033 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.773389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0022  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0039  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0040  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0040  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.565678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0015  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0020  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503685  hitchhiker  0.000000175517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0024  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000359356  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0006  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>