18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2868 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1903  AsmA  61.8 
 
 
879 aa  912    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.392482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2054  AsmA  62.21 
 
 
878 aa  934    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.588924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1824  AsmA  61.8 
 
 
879 aa  915    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2868  AsmA family protein  100 
 
 
874 aa  1657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0643104  normal  0.0555771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  26.9 
 
 
1210 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.67 
 
 
797 aa  55.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  32.57 
 
 
1098 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  27.41 
 
 
740 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  23.96 
 
 
809 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  23.17 
 
 
767 aa  48.5  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  30 
 
 
602 aa  48.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  29.71 
 
 
701 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  27.94 
 
 
741 aa  47  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  26.84 
 
 
1124 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.64 
 
 
893 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  28.77 
 
 
1515 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  25 
 
 
1264 aa  45.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  21.88 
 
 
892 aa  44.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>