18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6794 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  49.21 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  37.76 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  36.54 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  36.43 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  38.64 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  35.02 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  32.94 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  35.03 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  33.73 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  33.2 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  25.42 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  26.92 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  32.61 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  30.32 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>