27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5796 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  78.14 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  75.5 
 
 		 272 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  76.25 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  75.62 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  75.62 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  75.62 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  74.51 
 
 		 270 aa  361  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  68.57 
 
 		 284 aa  351  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  69.78 
 
 		 275 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  76.47 
 
 		 272 aa  344  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  67.92 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  73.53 
 
 		 274 aa  333  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  68.53 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  66.25 
 
 		 290 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  52.94 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  50.83 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  48.09 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  54.55 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  52.73 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  52.73 
 
 		 85 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  45.76 
 
 		 91 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  44.07 
 
 		 115 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  44.83 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  41.07 
 
 		 113 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>