19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5164 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  530  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3084  hypothetical protein  65.55 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03920  hypothetical protein  53.45 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  49.12 
 
 		 1056 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  39.77 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  38.54 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  29.36 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.67 
 
 		 2272 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  35.05 
 
 		 120 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  29.17 
 
 		 2179 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  38.93 
 
 		 985 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 533 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  30.11 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  31.03 
 
 		 848 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  29.1 
 
 		 685 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2641  hypothetical protein  36.46 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  34.93 
 
 		 479 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5661  hypothetical protein  33.82 
 
 		 138 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.56 
 
 		 2449 aa  42.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>