38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4758 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 824 aa  1664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.48 
 
 		 632 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.44 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.79 
 
 		 428 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.68 
 
 		 432 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 446 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.35 
 
 		 626 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.35 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  31.23 
 
 		 606 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.1 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.31 
 
 		 378 aa  101  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.75 
 
 		 1074 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.61 
 
 		 1034 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.52 
 
 		 1061 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.88 
 
 		 1034 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  28.57 
 
 		 403 aa  94.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.36 
 
 		 356 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  26.05 
 
 		 815 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  24.86 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.18 
 
 		 773 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.81 
 
 		 889 aa  71.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.84 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.53 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.12 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.61 
 
 		 379 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.23 
 
 		 559 aa  57  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  23.23 
 
 		 586 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.62 
 
 		 563 aa  53.5  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.39 
 
 		 563 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.91 
 
 		 557 aa  51.6  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  22.26 
 
 		 502 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.66 
 
 		 561 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 557 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.15 
 
 		 457 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  28.06 
 
 		 356 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>