18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4507 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4507  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  160  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  47.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  32.67 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  36.04 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  32.14 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  52.08 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  52.08 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  52.08 
 
 		 114 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  31.67 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  30.56 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  52.08 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3592  hypothetical protein  57.78 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3602  hypothetical protein  57.78 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0960  hypothetical protein  57.78 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  30.97 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0664  hypothetical protein  57.78 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>