More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3683 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3683  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1059 aa  2052    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  34.15 
 
 
2156 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  33.49 
 
 
2156 aa  579  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.46 
 
 
2156 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  36.95 
 
 
2573 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  38.77 
 
 
6661 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  36 
 
 
1114 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.7 
 
 
5953 aa  526  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.9 
 
 
3308 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.98 
 
 
8914 aa  516  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.64 
 
 
2033 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  36.99 
 
 
1769 aa  506  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  37.52 
 
 
7310 aa  506  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.96 
 
 
1839 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  31.32 
 
 
3235 aa  501  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  35.88 
 
 
5654 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.06 
 
 
6403 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 
1556 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.69 
 
 
4531 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  30.86 
 
 
4354 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.59 
 
 
2138 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  30.37 
 
 
1556 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  38.24 
 
 
2350 aa  492  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.24 
 
 
3176 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.7 
 
 
3498 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.48 
 
 
4960 aa  486  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.87 
 
 
2370 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.76 
 
 
4968 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.69 
 
 
6889 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32.7 
 
 
1578 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.31 
 
 
6676 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.94 
 
 
8646 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.79 
 
 
4960 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.76 
 
 
3432 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  28.2 
 
 
1568 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  35.73 
 
 
1110 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  36.11 
 
 
4090 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.3 
 
 
2151 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  31.37 
 
 
1550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 
1816 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.94 
 
 
2581 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  36.96 
 
 
4383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.78 
 
 
3291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.06 
 
 
3348 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30.49 
 
 
2193 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.72 
 
 
3086 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.72 
 
 
3086 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.21 
 
 
1776 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.1 
 
 
4747 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.71 
 
 
3002 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  34.98 
 
 
5596 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.07 
 
 
3291 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.21 
 
 
2571 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  30.96 
 
 
1142 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  34.22 
 
 
5328 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.11 
 
 
1833 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.65 
 
 
3470 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.3 
 
 
2571 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  30.2 
 
 
2164 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  34.14 
 
 
2154 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.17 
 
 
1789 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.49 
 
 
4502 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  35.1 
 
 
1369 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  37.37 
 
 
1083 aa  459  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  33.21 
 
 
3432 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.1 
 
 
1876 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  34.41 
 
 
2125 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.59 
 
 
6081 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.19 
 
 
4991 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.57 
 
 
2385 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  30.9 
 
 
1786 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  34.24 
 
 
6072 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.57 
 
 
2385 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.57 
 
 
1864 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  34.65 
 
 
3404 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  32.01 
 
 
1569 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.23 
 
 
2385 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.52 
 
 
1753 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.1 
 
 
2385 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  38.42 
 
 
8211 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.51 
 
 
2385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  32.46 
 
 
2419 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  33.81 
 
 
4572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.47 
 
 
2385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  35.57 
 
 
8915 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  37.2 
 
 
2106 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.89 
 
 
2386 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.25 
 
 
2385 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  36.81 
 
 
1726 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.26 
 
 
2385 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  33.93 
 
 
4468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  35.45 
 
 
1104 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.08 
 
 
4336 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  31.41 
 
 
2385 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.99 
 
 
2867 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.55 
 
 
1829 aa  446  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 
2508 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  31.23 
 
 
3453 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.28 
 
 
5926 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  35.17 
 
 
5372 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>