18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1894 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  69.23 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  68.27 
 
 		 416 aa  534  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  26.26 
 
 		 354 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  28.78 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  26.35 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  26.3 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  26.51 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  28 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  24.37 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  26.36 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  26 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  24.67 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1357 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1349 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  24.7 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  32.57 
 
 		 274 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>