26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0560 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  43.59 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  41.55 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  41.41 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  41.41 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  41.86 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  44.8 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  36.02 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  39.86 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  44.6 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  43.41 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  40.14 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  40.14 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  38.36 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  39.44 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  38.03 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  38.03 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  38.03 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  45.6 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  40.8 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  31.87 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  35.04 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  35.04 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  28.97 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  35.62 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  27.61 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>