16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0503 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0503  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03420  hypothetical protein  46.32 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3561  hypothetical protein  44.24 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0809  hypothetical protein  41.22 
 
 		 220 aa  94.4  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.612305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2998  hypothetical protein  43.8 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0626  putative secreted lipoprotein  34.35 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0724  hypothetical protein  40.95 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00634276  normal  0.0883262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0753  putative secreted lipoprotein  32.52 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0713  hypothetical protein  28.39 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3513  hypothetical protein  35.35 
 
 		 251 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4762  hypothetical protein  30.22 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0554  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  30.23 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3180  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0196071  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 		 590 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5412  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.336046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>