15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03420  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3561  hypothetical protein  60.29 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0503  hypothetical protein  46.32 
 
 		 178 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0809  hypothetical protein  44.44 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.612305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2470  hypothetical protein  40.79 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0626  putative secreted lipoprotein  42.86 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0753  putative secreted lipoprotein  36.88 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0713  hypothetical protein  33.6 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2998  hypothetical protein  37.41 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3513  hypothetical protein  32.41 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0724  hypothetical protein  39.32 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00634276  normal  0.0883262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3180  hypothetical protein  28.31 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0196071  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6255  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4762  hypothetical protein  26.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 590 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>