14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3561 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3561  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  410  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03420  hypothetical protein  60.29 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0503  hypothetical protein  45.75 
 
 		 178 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0809  hypothetical protein  41.35 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.612305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2470  hypothetical protein  43.09 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0753  putative secreted lipoprotein  36.32 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0626  putative secreted lipoprotein  32.89 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4762  hypothetical protein  33.12 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0713  hypothetical protein  33.6 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0724  hypothetical protein  38.58 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00634276  normal  0.0883262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2998  hypothetical protein  36.55 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3513  hypothetical protein  32.21 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3180  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0196071  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6255  hypothetical protein  33.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>