14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3513 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3513  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2998  hypothetical protein  44.36 
 
 		 185 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0724  hypothetical protein  41.88 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00634276  normal  0.0883262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0626  putative secreted lipoprotein  36.81 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03420  hypothetical protein  32.41 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2470  hypothetical protein  47.13 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3561  hypothetical protein  32.21 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0753  putative secreted lipoprotein  32.86 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0809  hypothetical protein  28.47 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.612305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0503  hypothetical protein  35.35 
 
 		 178 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3180  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0196071  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1955  hypothetical protein  40.71 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0713  hypothetical protein  29.81 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6255  hypothetical protein  30.91 
 
 		 194 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>