63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0339 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0339  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
103 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0960  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  71 
 
 
102 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35390  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  70.41 
 
 
99 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  71.13 
 
 
105 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.39 
 
 
99 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  72.45 
 
 
101 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.53 
 
 
117 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.35 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.32 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.32 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.32 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0205  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.41 
 
 
119 aa  120  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.776817  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  56.31 
 
 
109 aa  106  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.857641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  55.79 
 
 
94 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  42.72 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.62 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  38.21 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0234  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.95 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.75 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.54 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.48 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3377  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.16 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000506782  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.25 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.08 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.08 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.92 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  34.25 
 
 
167 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  34.25 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  34.25 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  34.25 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  34.25 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  34.25 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  32.91 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  32.91 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  32.91 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.71 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  36.05 
 
 
274 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  27.03 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  36.46 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  33.7 
 
 
323 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
138 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>