46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4093 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 583 aa  1167    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  75.66 
 
 		 582 aa  765    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  62.16 
 
 		 543 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  60.45 
 
 		 580 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  50.36 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  41.49 
 
 		 550 aa  330  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 487 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  34.38 
 
 		 536 aa  293  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  38.39 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  38.83 
 
 		 540 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  38.83 
 
 		 540 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  38.32 
 
 		 540 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  38.32 
 
 		 540 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  38.24 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  37.68 
 
 		 539 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  37.68 
 
 		 539 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  37.68 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  36.69 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  36.46 
 
 		 539 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  37.39 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.64 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  27.21 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  27.21 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  24.26 
 
 		 504 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.83 
 
 		 459 aa  50.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  24.69 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  26.63 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  26.63 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  30.39 
 
 		 488 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  29.75 
 
 		 514 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  30.11 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.33 
 
 		 493 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  44.64 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  29.63 
 
 		 161 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.17 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  47.37 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3696  hypothetical protein  37.11 
 
 		 608 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.761481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  43.1 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.93 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  37.68 
 
 		 527 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 512 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  24.31 
 
 		 435 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.39 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25.73 
 
 		 494 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 556 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>