12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2876 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  333  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  98.71 
 
 
155 aa  298  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1385  hypothetical protein  61.36 
 
 
182 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.940229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  62.58 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  54.72 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1817  hypothetical protein  50 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  45.66 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  29.41 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  26.04 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3188  hypothetical protein  28.67 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.729943  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  25.62 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0239807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>