19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1595 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  75.54 
 
 
246 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  40 
 
 
243 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  43.97 
 
 
242 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  43.1 
 
 
242 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  43.67 
 
 
239 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  37.44 
 
 
240 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  37.44 
 
 
240 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  35.37 
 
 
247 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  37.66 
 
 
240 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  33.99 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  30.2 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  31.58 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  29.24 
 
 
242 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  27.69 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  27.83 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0538  hypothetical protein  27.1 
 
 
212 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>