46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1892 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1654  hypothetical protein  87.68 
 
 		 1023 bp  942    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.696062  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    100 
 
 		 1291 bp  2559    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    100 
 
 		 3611 bp  7158    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0689    99.15 
 
 		 1925 bp  2470    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.562449  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    83.51 
 
 		 1113 bp  615  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 879 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 879 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 879 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 831 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 879 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 879 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  87.42 
 
 		 879 bp  430  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1165    82.75 
 
 		 905 bp  412  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1655  hypothetical protein  94.07 
 
 		 270 bp  408  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.549221  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1619    86.15 
 
 		 889 bp  369  4e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1051  Integrase catalytic region  90.25 
 
 		 996 bp  329  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  85.51 
 
 		 879 bp  313  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  84.78 
 
 		 879 bp  307  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0516    85.51 
 
 		 279 bp  230  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0159275  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1972    84.62 
 
 		 798 bp  220  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0551    86.19 
 
 		 3086 bp  212  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1867    86.81 
 
 		 353 bp  204  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0514    90.24 
 
 		 177 bp  198  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.35244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0069  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1470 bp  180  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 1566 bp  178  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1312    81.47 
 
 		 965 bp  163  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.293835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0547    84.57 
 
 		 420 bp  135  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    89.04 
 
 		 1271 bp  81.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0675    87.84 
 
 		 84 bp  75.8  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    83 
 
 		 1213 bp  63.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    89.8 
 
 		 2780 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1866  Type II site-specific deoxyribonuclease  91.11 
 
 		 609 bp  58  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    89.8 
 
 		 2433 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1233 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1233 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1233 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1317    82.22 
 
 		 90 bp  52  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.16591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>