35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0923 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  32.44 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  36.49 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  32 
 
 
232 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  32.35 
 
 
238 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  25.93 
 
 
233 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  31.76 
 
 
231 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  33.03 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  33.06 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  26.67 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  26.82 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  27.31 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  27.93 
 
 
292 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  28.91 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  28.51 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  27.35 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  31.7 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  35.14 
 
 
347 aa  48.9  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  24.78 
 
 
223 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  26.32 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  26.01 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  24.88 
 
 
347 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  24.02 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  30.5 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  25.88 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  25.87 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  25.87 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  25.87 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2697  hypothetical protein  25.69 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0651215  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  25.48 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  34.38 
 
 
357 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  31.75 
 
 
362 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  31.15 
 
 
352 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  24.83 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  24.83 
 
 
347 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>