26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0774 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  100 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  54.11 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  53.42 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  53.42 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  48.15 
 
 
165 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  48.15 
 
 
165 aa  154  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  48.15 
 
 
165 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  51.77 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  50.72 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  47.92 
 
 
166 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  45 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  41.42 
 
 
173 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  52.31 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  46.41 
 
 
171 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  46.15 
 
 
159 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  46.15 
 
 
159 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  40.99 
 
 
165 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  38.51 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  37.65 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  36.65 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  38.13 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  41.77 
 
 
160 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  39.44 
 
 
176 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  31.58 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>