15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4212 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4212  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  50.78 
 
 
142 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4181  hypothetical protein  39.68 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.994158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  33.86 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  33.86 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  32 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  30.5 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  30.61 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  32.8 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  39.51 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  29.23 
 
 
261 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>