27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0227 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0227  Protein of unknown function DUF516  100 
 
 
273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420083  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1941  hypothetical protein  35.38 
 
 
479 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000577788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2181  hypothetical protein  40.43 
 
 
306 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.175616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0408  hypothetical protein  31.11 
 
 
441 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2266  hypothetical protein  34.56 
 
 
458 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000113487  normal  0.0819386 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1586  hypothetical protein  33.94 
 
 
443 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000507896  hitchhiker  0.00416523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0158  hypothetical protein  32.48 
 
 
435 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0387  hypothetical protein  29.52 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0733  hypothetical protein  36.67 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00487772  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0095  hypothetical protein  29.5 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.342459  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0773  hypothetical protein  30.18 
 
 
269 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0231  hypothetical protein  35.44 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0661  hypothetical protein  31.1 
 
 
442 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000499977  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2476  hypothetical protein  26.58 
 
 
450 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0316  hypothetical protein  34.63 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0809  hypothetical protein  34.83 
 
 
254 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1372  Protein of unknown function DUF516  27.54 
 
 
444 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1669  hypothetical protein  34.33 
 
 
254 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.987983  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2781  Protein of unknown function DUF516  32.8 
 
 
486 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0640  hypothetical protein  32.2 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000906628  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2934  Protein of unknown function DUF516  27.27 
 
 
453 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0227101  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0054  Protein of unknown function DUF516  32.02 
 
 
238 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1544  hypothetical protein  30 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0140701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1476  hypothetical protein  30.2 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0902  hypothetical protein  24.76 
 
 
493 aa  75.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.757817  normal  0.396557 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1672  hypothetical protein  29.59 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000720356 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0774  hypothetical protein  30.43 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.0296069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>