27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0027 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  52.05 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  48.68 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  51.9 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  48 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  44.59 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  50.63 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  46.84 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  41.89 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  41.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  40.54 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  44.74 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  38.67 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  45.95 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  40 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  40 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  40.7 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  38.37 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  38.37 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  40 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  38.37 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  32.88 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  32.88 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0201  ribosomal protein L31e  40.26 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.802964  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  35.56 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  34.25 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1324  LSU ribosomal protein L31E (rpl31E)  40.54 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.646557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>