14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3997 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  66.78 
 
 
288 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  64.48 
 
 
262 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  62.8 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  62.2 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  64.29 
 
 
281 aa  308  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  55.52 
 
 
251 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  58.44 
 
 
292 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  60.34 
 
 
294 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  60.14 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  31.05 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  28.24 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  26.24 
 
 
401 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  29.02 
 
 
483 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>