18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0990 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  61.48 
 
 
289 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  57.91 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  52.96 
 
 
302 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  80.92 
 
 
146 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  67.48 
 
 
161 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  52.29 
 
 
194 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  32.83 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  30.48 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  50.36 
 
 
140 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  32.5 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  31.25 
 
 
396 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  24.65 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  25.82 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1102  hypothetical protein  43.9 
 
 
92 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  23.58 
 
 
407 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  29.17 
 
 
150 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  32.14 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>