18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1399 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  32.76 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  28.06 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  27.93 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  30.09 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  29.91 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  25.42 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  25.2 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  25.64 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  25.64 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  25.66 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  25.66 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  27.19 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  27.62 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  22.41 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  23.73 
 
 		 130 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  28.81 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>