21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06301 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  100 
 
 
89 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  89.89 
 
 
89 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  84.27 
 
 
89 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  82.02 
 
 
89 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  62.92 
 
 
89 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  57.3 
 
 
89 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  56.18 
 
 
89 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  50.56 
 
 
89 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  49.44 
 
 
89 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  50.56 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  47.19 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  47.19 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  46.07 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  44.94 
 
 
89 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  44.94 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  28.12 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  28.12 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  28.12 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  27.08 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  27.37 
 
 
100 aa  40  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  27.06 
 
 
95 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>