74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04501 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_04501  putative deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
219 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04191  putative deoxyribose-phosphate aldolase  94.06 
 
 
219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0292917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0395  putative deoxyribose-phosphate aldolase  85.39 
 
 
219 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.054559  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04611  putative deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03971  putative deoxyribose-phosphate aldolase  29.86 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21421  putative deoxyribose-phosphate aldolase  26.89 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1734  deoxyribose-phosphate aldolase  31.07 
 
 
227 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0657  deoxyribose-phosphate aldolase  27.45 
 
 
226 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04511  putative deoxyribose-phosphate aldolase  31.07 
 
 
227 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2014  deoxyribose-phosphate aldolase  24.74 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  26.07 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  22.6 
 
 
317 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  24.55 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  24.07 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  24.88 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  21.03 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  22.17 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  25 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  22.07 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  22.97 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  19.53 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  20.09 
 
 
260 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2974  deoxyribose-phosphate aldolase  20.17 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  22.87 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  23.58 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  25.93 
 
 
222 aa  52  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  22.93 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  23.04 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  23.56 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  20.48 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  22.47 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl639  deoxyribose-phosphate aldolase  21.96 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  19.72 
 
 
248 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  21.36 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  21.76 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  21.9 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  25 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  21.8 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  20.4 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  22.53 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0983  deoxyribose-phosphate aldolase  20.67 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231215  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4603  deoxyribose-phosphate aldolase  22.56 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  21.76 
 
 
256 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  21.2 
 
 
241 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  22.27 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  19.63 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  21.66 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  24.07 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  22.17 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  22.39 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  26.77 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6946  deoxyribose-phosphate aldolase  22.4 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1543  deoxyribose-phosphate aldolase  22.4 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  22.4 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.576612 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  22.32 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  23.68 
 
 
220 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  21.31 
 
 
222 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  20.95 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  22.17 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  21 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  22.39 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  21.62 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  19.52 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  19.82 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  24.14 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  21.21 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  26.03 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  18.68 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  24.06 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  19.18 
 
 
424 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0950  deoxyribose-phosphate aldolase  19.1 
 
 
226 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  18.68 
 
 
223 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  20.95 
 
 
231 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  23.08 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>