17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1557 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1557  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1462  hypothetical protein  99.54 
 
 
218 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2401  hypothetical protein  92.66 
 
 
218 aa  361  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0200192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0245  hypothetical protein  76.63 
 
 
228 aa  277  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175381  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1804  hypothetical protein  47.54 
 
 
206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.424429  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  36.97 
 
 
341 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0448  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000438737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0210  hypothetical protein  37.43 
 
 
199 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1930  hypothetical protein  32.12 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  31.55 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2013  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0008  hypothetical protein  24.52 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1164  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.828155  normal  0.0879348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1299  hypothetical protein  25.41 
 
 
260 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0330759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0441  hypothetical protein  26.59 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.264728  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1728  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.715812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1568  hypothetical protein  25.4 
 
 
330 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00971838  normal  0.55843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>