16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1285 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1155  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  89.66 
 
 		 406 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1215  surface antigen variable number repeat protein  96.07 
 
 		 407 aa  723    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1285  surface antigen variable number repeat protein  100 
 
 		 407 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  28.72 
 
 		 744 aa  56.2  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.78 
 
 		 895 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  23.66 
 
 		 553 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  30.83 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  32.52 
 
 		 834 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  33.9 
 
 		 843 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 794 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  28.07 
 
 		 778 aa  44.7  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.52 
 
 		 856 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  28.7 
 
 		 773 aa  43.9  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  33.05 
 
 		 843 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  31.62 
 
 		 798 aa  43.1  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.21 
 
 		 769 aa  43.1  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>