32 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dtur_0019  CDS  NC_011661  22262  23353  1092  hypothetical protein  YP_002351974  unclonable  1.82586e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0043  CDS  NC_011661  43913  44830  918  Peptidase M23  YP_002351995  unclonable  6.81555e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0064  CDS  NC_011661  63415  64650  1236  competence/damage-inducible protein CinA  YP_002352016  unclonable  9.39052e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0162  CDS  NC_011661  150544  152406  1863  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002352107  unclonable  3.59667e-08  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0243  CDS  NC_011661  244575  245645  1071  Endo-1,4-beta-xylanase  YP_002352183  unclonable  2.83811e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0305  CDS  NC_011661  312073  313641  1569  ferredoxin-dependent glutamate synthase  YP_002352241  unclonable  5.5557e-09  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0450  CDS  NC_011661  457446  458153  708  polysaccharide deacetylase  YP_002352365  unclonable  3.80571e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0863  CDS  NC_011661  888119  890203  2085  S-layer domain protein  YP_002352758  unclonable  1.21904e-07  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0932  CDS  NC_011661  962551  963681  1131  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002352827  unclonable  5.68006e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0973  CDS  NC_011661  1002028  1002300  273  protein of unknown function UPF0016  YP_002352867  unclonable  1.16489e-12  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1003  CDS  NC_011661  1025867  1026118  252  translation initiation factor IF-1  YP_002352897  unclonable  1.30105e-12  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1004  CDS  NC_011661  1026108  1026221  114  50S ribosomal protein L36  YP_002352898  unclonable  5.66406e-13  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1005  CDS  NC_011661  1026236  1026610  375  30S ribosomal protein S13  YP_002352899  unclonable  3.43576e-12  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1065  CDS  NC_011661  1081941  1084046  2106  oligopeptide binding protein, putative  YP_002352959  unclonable  1.59871e-07  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1101  CDS  NC_011661  1121141  1122268  1128  Peptidase M23  YP_002352994  unclonable  1.52343e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1137  CDS  NC_011661  1155627  1156508  882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002353030  unclonable  2.96229e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1204  CDS  NC_011661  1222380  1222676  297  hypothetical protein  YP_002353097  unclonable  2.9262e-12  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1205  CDS  NC_011661  1222827  1223297  471  protein of unknown function DUF150  YP_002353098  unclonable  8.54014e-12  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1331  CDS  NC_011661  1349552  1350805  1254  MiaB-like tRNA modifying enzyme  YP_002353219  unclonable  5.62047e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1377  CDS  NC_011661  1389102  1389251  150  ribosomal protein L33  YP_002353265  unclonable  3.60963e-13  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1378  CDS  NC_011661  1389276  1390493  1218  elongation factor Tu  YP_002353266  unclonable  8.57759e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1384  CDS  NC_011661  1397457  1400069  2613  TPR repeat-containing protein  YP_002353272  unclonable  1.49301e-06  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1416  CDS  NC_011661  1429336  1430577  1242  phosphoribosylamine/glycine ligase  YP_002353304  unclonable  5.07728e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1538  CDS  NC_011661  1547502  1548812  1311  signal recognition particle protein  YP_002353426  unclonable  1.6303e-09  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1642  CDS  NC_011661  1657827  1658780  954  Monosaccharide-transporting ATPase  YP_002353529  unclonable  6.22557e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1708  CDS  NC_011661  1726057  1727085  1029  transcriptional regulator, LacI family  YP_002353594  unclonable  9.20501e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1724  CDS  NC_011661  1745639  1747516  1878  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002353610  unclonable  1.47125e-08  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1732  CDS  NC_011661  1755212  1756459  1248  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002353618  unclonable  3.68486e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1736  CDS  NC_011661  1760449  1761450  1002  transcriptional regulator, LacI family  YP_002353622  unclonable  4.003e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1737  CDS  NC_011661  1761585  1762340  756  hypothetical protein  YP_002353623  unclonable  1.79479e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1761  CDS  NC_011661  1797509  1797799  291  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_002353647  unclonable  1.06406e-12  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1762  CDS  NC_011661  1797864  1799585  1722  hypothetical protein  YP_002353648  unclonable  2.11231e-08  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>