17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BamMC406_0237  CDS  NC_010551  272170  273090  921  LysR family transcriptional regulator  YP_001806954  hitchhiker  6.18389e-08  unclonable  2.50683e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0238  CDS  NC_010551  273296  274129  834  OmpW family protein  YP_001806955  hitchhiker  6.89668e-10  unclonable  3.00165e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0277  CDS  NC_010551  328607  329227  621  50S ribosomal protein L4  YP_001806994  unclonable  6.96788e-12  normal  0.0754371  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0474  CDS  NC_010551  530231  531007  777  enoyl-CoA hydratase  YP_001807187  unclonable  2.53276e-11  normal  0.535209  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_1177  CDS  NC_010551  1298799  1300388  1590  lytic transglycosylase catalytic  YP_001807884  unclonable  1.11267e-09  normal  0.0154135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_1862  CDS  NC_010551  2077416  2079935  2520  1A family penicillin-binding protein  YP_001808560  unclonable  1.45704e-07  hitchhiker  9.25337e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2435  CDS  NC_010551  2703348  2704727  1380  amino acid permease-associated region  YP_001809129  normal  0.0155643  unclonable  3.41886e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2436  CDS  NC_010551  2704830  2707130  2301  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  YP_001809130  normal  0.0100444  unclonable  6.29584e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2437  CDS  NC_010551  2707127  2707441  315  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_001809131  hitchhiker  1.47491e-06  unclonable  1.78377e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2438  CDS  NC_010551  2707991  2708194  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001809132  unclonable  1.80609e-12  unclonable  1.76576e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2439  CDS  NC_010551  2708442  2710655  2214  YadA domain-containing protein  YP_001809133  hitchhiker  1.09302e-05  unclonable  5.63921e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2440  CDS  NC_010551  2711074  2712672  1599  multicopper oxidase type 3  YP_001809134  normal  0.375072  unclonable  4.13546e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2441  CDS  NC_010551  2713336  2713560  225  hypothetical protein  YP_001809135  normal  0.343046  unclonable  1.51958e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2442  CDS  NC_010551  2713690  2715918  2229  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  YP_001809136  normal  unclonable  6.48853e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_R0017  rRNA  NC_010551  531562  533087  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  9.48011e-10  normal  0.820797  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_R0058  tRNA  NC_010551  2181343  2181418  76  tRNA-Ala    unclonable  6.13252e-13  normal  0.244453  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_R0067  rRNA  NC_010551  2384659  2386184  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  5.9225e-10  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>