75 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cyan8802_0053  CDS  NC_013161  55855  57237  1383  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  YP_003135860  unclonable  4.98494e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0063  CDS  NC_013161  64971  65942  972  NmrA family protein  YP_003135869  unclonable  2.16715e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0064  CDS  NC_013161  65970  66887  918  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  YP_003135870  unclonable  1.62022e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0156  CDS  NC_013161  160794  161573  780  protein serine/threonine phosphatase  YP_003135961  unclonable  2.23411e-06  normal  0.0165822  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0157  CDS  NC_013161  161925  162698  774  protein of unknown function DUF820  YP_003135962  unclonable  1.54086e-06  normal  0.0157865  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0213  CDS  NC_013161  209617  210048  432  protein of unknown function DUF29  YP_003136017  unclonable  7.62882e-07  decreased coverage  0.000484269  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0418  CDS  NC_013161  413320  414123  804  protein of unknown function DUF1555  YP_003136212  unclonable  3.11091e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0442  CDS  NC_013161  436861  438285  1425  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_003136236  unclonable  1.12468e-05  normal  0.115527  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0443  CDS  NC_013161  438743  440743  2001  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_003136237  unclonable  4.73343e-05  normal  0.0116841  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0519  CDS  NC_013161  511604  512416  813  Squalene/phytoene synthase  YP_003136302  unclonable  1.72077e-06  unclonable  4.42805e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0897  CDS  NC_013161  911877  912758  882  peptidase S13 D-Ala-D-Ala carboxypeptidase C  YP_003136668  unclonable  3.40535e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0971  CDS  NC_013161  995028  995477  450  protein of unknown function DUF29  YP_003136740  unclonable  5.75835e-07  normal  0.0486362  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0972  CDS  NC_013161  995533  996582  1050  recombinase A  YP_003136741  unclonable  4.64693e-06  normal  0.0586083  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1045  CDS  NC_013161  1068447  1069628  1182  DNA polymerase III subunit beta  YP_003136812  hitchhiker  0.000409555  unclonable  2.81863e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1046  CDS  NC_013161  1070710  1071672  963  ABC transporter related  YP_003136813  hitchhiker  0.000262053  unclonable  3.21405e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1047  CDS  NC_013161  1071702  1072487  786  ABC-2 type transporter  YP_003136814  normal  0.0215536  unclonable  2.90694e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1048  CDS  NC_013161  1072527  1074338  1812  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  YP_003136815  normal  0.110621  unclonable  4.84608e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1187  CDS  NC_013161  1210881  1211588  708  protein of unknown function DUF820  YP_003136951  unclonable  1.33784e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1188  CDS  NC_013161  1211680  1213167  1488  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_003136952  unclonable  9.48034e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1267  CDS  NC_013161  1289375  1290445  1071  photosystem q(b) protein  YP_003137025  unclonable  3.99793e-06  hitchhiker  0.00458282  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1268  CDS  NC_013161  1290598  1291179  582  protein of unknown function DUF820  YP_003137026  unclonable  1.36516e-06  hitchhiker  0.00936719  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1269  CDS  NC_013161  1291340  1291507  168  hypothetical protein  YP_003137027  unclonable  4.21626e-07  hitchhiker  0.00880749  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1345  CDS  NC_013161  1370116  1370961  846  protein of unknown function DUF820  YP_003137103  normal  0.05834  unclonable  2.08542e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1983  CDS  NC_013161  2004549  2004797  249  30S ribosomal protein S16  YP_003137709  unclonable  4.39019e-07  normal  0.0268459  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1984  CDS  NC_013161  2004951  2005553  603  protein of unknown function DUF218  YP_003137710  unclonable  1.11651e-06  normal  0.0299035  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1985  CDS  NC_013161  2005727  2006011  285  hypothetical protein  YP_003137711  unclonable  6.69596e-07  normal  0.0279875  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1986  CDS  NC_013161  2006061  2006330  270  hypothetical protein  YP_003137712  unclonable  6.56198e-07  normal  0.027281  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1987  CDS  NC_013161  2006599  2007657  1059  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  YP_003137713  unclonable  3.47488e-06  normal  0.0187293  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2041  CDS  NC_013161  2059092  2060162  1071  photosystem q(b) protein  YP_003137767  unclonable  2.21141e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2208  CDS  NC_013161  2216990  2220646  3657  hypothetical protein  YP_003137924  unclonable  0.00220427  normal  0.956264  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2270  CDS  NC_013161  2285872  2288055  2184  Peptidase M23  YP_003137984  unclonable  5.39525e-05  unclonable  8.07187e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2714  CDS  NC_013161  2745203  2745700  498  photosystem I reaction center protein PsaF subunit III  YP_003138409  unclonable  7.62882e-07  normal  0.402807  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2715  CDS  NC_013161  2745801  2745929  129  photosystem I reaction center subunit IX  YP_003138410  unclonable  2.94033e-07  normal  0.375601  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2716  CDS  NC_013161  2746058  2749429  3372  putative transcriptional regulator  YP_003138411  unclonable  0.000820476  normal  0.236594  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2737  CDS  NC_013161  2768188  2769687  1500  C-3',4' desaturase CrtD  YP_003138431  unclonable  9.28862e-06  unclonable  4.08673e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2738  CDS  NC_013161  2770060  2770677  618  protein of unknown function DUF820  YP_003138432  unclonable  2.01977e-06  unclonable  2.57493e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2739    NC_013161  2770700  2770774  75      hitchhiker  0.000356275  unclonable  1.98286e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2740  CDS  NC_013161  2770810  2771163  354  hypothetical protein  YP_003138433  hitchhiker  0.000628686  unclonable  2.128e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2741  CDS  NC_013161  2771273  2772274  1002  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_003138434  hitchhiker  0.00698708  unclonable  2.87618e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2742  CDS  NC_013161  2772337  2773371  1035  protein of unknown function UPF0118  YP_003138435  normal  0.0922989  unclonable  2.68058e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2743  CDS  NC_013161  2773384  2773593  210  hypothetical protein  YP_003138436  normal  unclonable  1.72345e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2744  CDS  NC_013161  2773613  2775055  1443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  YP_003138437  normal  unclonable  3.14973e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2863  CDS  NC_013161  2890968  2891579  612  protein of unknown function DUF820  YP_003138548  unclonable  1.18606e-06  decreased coverage  9.38837e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2915  CDS  NC_013161  2952434  2953756  1323  Extracellular ligand-binding receptor  YP_003138598  unclonable  1.11325e-05  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3051  CDS  NC_013161  3084580  3086106  1527  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  YP_003138732  unclonable  9.97071e-06  normal  0.381945  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3119  CDS  NC_013161  3188964  3189557  594  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  YP_003138795  unclonable  1.12797e-06  normal  0.654316  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3147  CDS  NC_013161  3217240  3217566  327  Rare lipoprotein A  YP_003138821  unclonable  5.99592e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3148  CDS  NC_013161  3217778  3218527  750  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003138822  unclonable  1.45051e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3474  CDS  NC_013161  3543070  3543213  144  hypothetical protein  YP_003139133  unclonable  1.74771e-07  normal  0.190022  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3475  CDS  NC_013161  3543771  3544352  582  protein of unknown function DUF820  YP_003139134  unclonable  4.39019e-07  normal  0.0457719  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3732  CDS  NC_013161  3820293  3821309  1017  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_003139379  unclonable  5.34753e-06  normal  0.117524  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3733  CDS  NC_013161  3821393  3822271  879  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  YP_003139380  unclonable  3.11091e-06  normal  0.111305  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3734  CDS  NC_013161  3822566  3823357  792  protein of unknown function DUF1555  YP_003139381  unclonable  2.34967e-06  normal  0.106444  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3921  CDS  NC_013161  4035396  4036094  699  hypothetical protein  YP_003139560  unclonable  1.40733e-06  normal  0.231164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3945  CDS  NC_013161  4065124  4065711  588  protein of unknown function DUF820  YP_003139584  unclonable  1.29802e-06  normal  0.0173908  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3980  CDS  NC_013161  4094525  4095523  999  phosphoribulokinase  YP_003139618  unclonable  2.34967e-06  decreased coverage  0.00010781  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4170  CDS  NC_013161  4303230  4304279  1050  rod shape-determining protein MreB  YP_003139797  unclonable  2.01977e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4244  CDS  NC_013161  4382709  4385138  2430  GTPase (dynamin-related)-like protein  YP_003139866  unclonable  0.000109098  hitchhiker  1.66794e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4245  CDS  NC_013161  4385377  4385715  339  KGK family protein  YP_003139867  unclonable  7.86451e-07  hitchhiker  4.69629e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4246  CDS  NC_013161  4385877  4386140  264  hypothetical protein  YP_003139868  unclonable  5.81747e-07  hitchhiker  4.07614e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4247  CDS  NC_013161  4386206  4386448  243  HNH endonuclease  YP_003139869  unclonable  4.85502e-07  hitchhiker  4.23624e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4248  CDS  NC_013161  4386449  4387390  942  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_003139870  unclonable  2.23411e-06  unclonable  2.87618e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4249  CDS  NC_013161  4387530  4388282  753  protein of unknown function DUF820  YP_003139871  unclonable  1.36516e-06  unclonable  2.39983e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4316  CDS  NC_013161  4461232  4462524  1293  carboxyl-terminal protease  YP_003139937  unclonable  6.8708e-06  hitchhiker  0.00121166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4324  CDS  NC_013161  4468450  4468917  468  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_003139945  unclonable  1.4654e-06  normal  0.0291528  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4376  CDS  NC_013161  4526624  4526956  333  hypothetical protein  YP_003139996  unclonable  5.005e-07  unclonable  1.43863e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4377  CDS  NC_013161  4526957  4527268  312  protein of unknown function DUF433  YP_003139997  unclonable  4.85502e-07  unclonable  1.40954e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4378  CDS  NC_013161  4527308  4527532  225  protein of unknown function UPF0150  YP_003139998  unclonable  4.52582e-07  unclonable  1.42401e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4379  CDS  NC_013161  4527548  4527772  225  YcfA family protein  YP_003139999  unclonable  3.96987e-07  unclonable  1.4534e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4380  CDS  NC_013161  4527765  4527992  228  protein of unknown function UPF0150  YP_003140000  unclonable  4.34558e-07  unclonable  1.5436e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4381  CDS  NC_013161  4528093  4528542  450  hypothetical protein  YP_003140001  unclonable  7.86451e-07  unclonable  2.00322e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4382  CDS  NC_013161  4528849  4532841  3993  magnesium chelatase subunit H  YP_003140002  normal  0.0354269  unclonable  1.62582e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4383  CDS  NC_013161  4532901  4533245  345  hypothetical protein  YP_003140003  normal  0.307645  unclonable  2.87618e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4384  CDS  NC_013161  4533242  4533451  210  hypothetical protein  YP_003140004  normal  0.635735  unclonable  2.54877e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4591  CDS  NC_013163  6533  7483  951  integrase family protein  YP_003142307  unclonable  4.27706e-09  n/a    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>