15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PputW619_0656  CDS  NC_010501  713519  714433  915  histone deacetylase superfamily protein  YP_001747530  unclonable  8.55576e-10  normal  0.416487  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_0685  CDS  NC_010501  755884  757008  1125  hypothetical protein  YP_001747559  unclonable  2.42198e-09  unclonable  1.18124e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_0686  CDS  NC_010501  757539  758519  981  phage integrase  YP_001747560  hitchhiker  0.00180883  unclonable  1.01632e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_1265  CDS  NC_010501  1404930  1405370  441  hypothetical protein  YP_001748139  unclonable  1.79686e-10  normal  0.0239094  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_1763  CDS  NC_010501  1960750  1961001  252  outer membrane lipoprotein OprI  YP_001748636  unclonable  7.37751e-11  unclonable  1.15764e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_3224  CDS  NC_010501  3558972  3559892  921  LysR family transcriptional regulator  YP_001750083  unclonable  1.48321e-09  normal  0.133263  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4030  CDS  NC_010501  4453691  4454758  1068  recombinase A  YP_001750879  normal  0.104307  unclonable  5.97568e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4031  CDS  NC_010501  4454862  4455344  483  CinA domain-containing protein  YP_001750880  normal  0.306417  unclonable  3.27829e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4032  CDS  NC_010501  4455428  4455904  477  phage protein  YP_001750881  normal  0.188318  unclonable  2.76525e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4033  CDS  NC_010501  4455901  4456449  549  glycoside hydrolase family protein  YP_001750882  normal  0.148282  unclonable  2.60373e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4034  CDS  NC_010501  4456477  4457511  1035  late control D family protein  YP_001750883  normal  0.356651  unclonable  3.37876e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4035  CDS  NC_010501  4457516  4457722  207  tail X family protein  YP_001750884  normal  0.743163  unclonable  1.67658e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4571  CDS  NC_010501  5047999  5048685  687  short chain dehydrogenase  YP_001751420  unclonable  7.28936e-10  hitchhiker  0.00656486  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4844  CDS  NC_010501  5342413  5343300  888  transporter DMT superfamily protein  YP_001751689  unclonable  4.46481e-10  normal  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_5117  CDS  NC_010501  5676048  5677574  1527  transcriptional regulator  YP_001751962  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>