146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Arg-3 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0090  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  91.23 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.31099e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0007  tRNA-Arg  97.56 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  91.23 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0120  tRNA-Arg  97.56 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0536302  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  92.86 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  91.07 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0022  tRNA-Arg  91.07 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  93.62 
 
 
80 bp  69.9  8e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  8.10736e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0035  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0060  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0022  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0070  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.644432  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0009  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0021  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0068  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0036  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0034  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.1136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0038  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217682  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0012  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0073  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0035  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228505  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0055    95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.594029  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0023  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0060  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0016  tRNA-Arg  95.12 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0054  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0067  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0035  tRNA-Arg  91.49 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0001  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.179964  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6028  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0235921 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0022  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761071  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0042  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00513283  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4199  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.81521e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5087  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.6915e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0001  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0091  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0005  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20883  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0954  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  3e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5230  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.96112e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4319  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  4.32818e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4157  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.33465e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4142  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.39333e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4161  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.89132e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0054  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0462421  normal  0.0117618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0525  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.96192e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0008  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000368398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0003  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.03446e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4211  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000122851  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4710  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.38627e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4260  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  9.5495e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0048  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.593319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00067  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  4.01991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0089  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0107  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.38441e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0001  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.436716 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0124  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.92514e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  88.52 
 
 
76 bp  58  3e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t16  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  3e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4322  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.17442e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5037  tRNA-Arg  94.59 
 
 
77 bp  58  3e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0097  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  2.63693e-05  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0050  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0057  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00918758  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0126  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  5.58638e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0018  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.574082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0001  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0018  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1247  tRNA-Arg  86.11 
 
 
78 bp  56  1e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.207064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0044  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.11 
 
 
78 bp  56  1e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00178807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0045  tRNA-Arg  86.11 
 
 
78 bp  56  1e-06  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.457382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R7  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365989  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0340  tRNA-Arg  86.21 
 
 
79 bp  52  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA1  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t01  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  3.74311e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03410  tRNA-Arg  86.21 
 
 
74 bp  52  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.39149e-07  hitchhiker  1.96604e-19 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  86.21 
 
 
74 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4334  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0610  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0978805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0002  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.259161  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0005  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345809  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0001  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>