147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0011 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
381 aa  743  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.21 
 
 
364 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 
360 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.46 
 
 
362 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  46.15 
 
 
371 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
373 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  45.51 
 
 
365 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  38.53 
 
 
367 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.55 
 
 
383 aa  225  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 
380 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  37.54 
 
 
366 aa  219  9e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  37.01 
 
 
365 aa  214  2e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  37.64 
 
 
364 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  37.64 
 
 
364 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  34.85 
 
 
367 aa  209  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  35.96 
 
 
362 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  36.57 
 
 
383 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  36.42 
 
 
367 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  36.42 
 
 
367 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.04 
 
 
374 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  36.42 
 
 
367 aa  200  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  36.42 
 
 
367 aa  200  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  36.12 
 
 
367 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  198  1e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  198  1e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
365 aa  199  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  37.42 
 
 
367 aa  197  2e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
373 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  36.21 
 
 
367 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 
369 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  33.9 
 
 
360 aa  192  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 
369 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 
369 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
368 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 
369 aa  191  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
364 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  37.95 
 
 
395 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  37.82 
 
 
398 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
385 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  35.18 
 
 
360 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  35.89 
 
 
364 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
367 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
366 aa  180  3e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 
363 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  33.24 
 
 
376 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  34.03 
 
 
374 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
364 aa  165  1e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  34.21 
 
 
379 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
363 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  34.77 
 
 
371 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
368 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  34.77 
 
 
371 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  34.48 
 
 
371 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  36.93 
 
 
372 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  33.81 
 
 
371 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 
360 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
377 aa  122  1e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 
373 aa  115  2e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
373 aa  113  7e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
396 aa  113  7e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
385 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
378 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
384 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  29.02 
 
 
359 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  30.67 
 
 
362 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
362 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  28.49 
 
 
362 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  28.49 
 
 
362 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  28.76 
 
 
362 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  29.94 
 
 
362 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  28.76 
 
 
362 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  30.33 
 
 
362 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  29.94 
 
 
362 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  31.15 
 
 
359 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  30.98 
 
 
361 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  33.55 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  30.96 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  31.3 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  31.3 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  31.3 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  32.95 
 
 
362 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  32.17 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  32.56 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  32.56 
 
 
362 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2314  hypothetical protein  31.87 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0458376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  32.33 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  32.2 
 
 
362 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
358 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  28.22 
 
 
366 aa  85.1  2e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1934  hypothetical protein  32.9 
 
 
362 aa  84.3  3e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.7 
 
 
367 aa  82  2e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  25.94 
 
 
358 aa  81.6  2e-14  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
339 aa  79.3  9e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>